Na trajetória da Fundação, as ações de prevenção, monitoramento, fiscalização e combate direto, tiveram prioridade sobre as unidades de conservação que são áreas de relevante interesse ecológico. Além disso, o esforço foi dirigido à defesa do ambiente focado no Pantanal.
Como fruto de todos seus esforços, a Fundação conseguiu diversos reconhecimentos, tanto nacionais como internacionais, tais como:
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Reconhecimento como Organização da Sociedade Civil de Interesse Público.
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Certificado de Homenagem atribuído pela Polícia Militar do Estado de Mato Grosso.
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Prêmio Ambiental Von Martius – Categoria Natureza.
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Prêmio UNESCO: Prêmio concedido pela Organização das Nações Unidas para Educação, Ciência e Cultura.
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Reserva da Biosfera: O Programa “O Homem e a Biosfera” foi criado pela UNESCO.
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Sítio do Patrimônio Natural Mundial: O reconhecimento do complexo de áreas protegidas do Pantanal.
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Prêmio Mundial de Meio Ambiente: Concedido pela WANGO.
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Rede Mundial "Lagos Vivos" (Living Lakes): Através de suas ações no Pantanal Mato-Grossense.